目前，RFID超高頻有兩個協議標準可供選擇。一是ISO18000-6B，另一個是已被ISO接納為ISO18000-6C的EPC C1G2標準。這兩個標準，各有優點。
ISO18000-6B標準
該標準定位于通用標準，應用比較成熟，產品性能相對穩定，數據格式和標準相對簡單。ISO18000-6B標準的主要特點包括：標準成熟、產品穩定、應用廣泛；ID號全球惟一；先讀ID號，后讀數據區；1024bits或2048bits的大容量；98Bytes或216Bytes的大用戶數據區；多標簽同時讀取，最多可同時讀取數十個標簽；數據讀取速度為40kbps。符合ISO18000-6B標準的電子標簽主要適用于資產管理等領域。目前國內開發的集裝箱標識電子標簽、電子車牌標簽、電子駕照（司機卡）均采用此標準的芯片。
根據ISO18000-6B標準的特點，從讀取速度和標簽數量來講，在卡口、碼頭作業等標簽數量不大的應用場合，應用ISO18000-6B標準的標簽基本能滿足需求。目前，中國海關物流監管系統中所使用的“電子車牌識別系統”使用的就是ISO18000-6B標準的電子標簽.
ISO18000-6B標準的不足之處在于：近幾年發展停滯，有被EPC C1G2取代的趨勢；用戶數據的軟件固化技術不太成熟，但這種情況可以通過芯片廠家將用戶數據嵌入解決。
應用案例：RFID讀寫器UR5306應用于智能產線工業自動化
ISO18000-6C（EPC C1G2）標準
該標準的特點是：速度快，數據速率可達40kbps～640kbps；可以同時讀取的標簽數量多，理論上能讀到1000多個標簽；首先讀EPC號碼，標簽的ID號需要用讀數據的方式讀取；功能強，具有多種寫保護方式，安全性強；區域多，分為EPC區（96bits或16Bytes，可擴展到512bits）、ID區（64bit或8Bytes）、用戶區(224bit或28Bytes)、密碼區(32bits或4 Bytes)，但有的廠商提供的標簽沒有用戶數據區，如Inpinj 的標簽。EPC C1G2標準主要適用于物流領域中大量物品的識別，正處于不斷發展之中。
EPC C1G2標準具有通用性強、符合EPC規則、產品價格低、兼容性好等眾多優點，但有如下問題需要考慮:
應用案例：RFID智能書架應用于共享圖書街頭微型圖書館
1、該標準的標簽產品及應用還不成熟，目前的標簽多為空氣介質。
2、用戶數據區小，只有28個字節，對于集裝箱標識電子標簽，如需將ISO10374所定義的集裝箱數據全部寫入，數據區容量不夠。
3、目前，用于EPC標簽的芯片幾乎都是倒貼片的，可焊接封裝的芯片極少。倒貼片的工藝對于長年工作在室外、運動、顛簸的物品來說，可靠性難以保證。
4、EPC C1G2電子標簽定位于通用性標簽，過于追求低廉的價格，其芯片設計和封裝設計對產品的環境適應性考慮較弱，如應用于集裝箱標識電子標簽這種環境適用性要求較高、使用壽命較長、應用領域相對專業的領域，芯片的技術、性能、工藝需要進一步提高。
5、該標準內含自毀程序，這對于集裝箱這種長期流動使用的運輸工具需要認真考慮。
根據以上分析比較可知，ISO18000-6B標準的電子標簽技術、應用比較成熟，如應用于集裝箱標簽，產品化、實用化步驟可快一點；對于EPC C1G2，首先要解決芯片的技術、性能、工藝等問題，需要得到國內外芯片商的大力支持，實用化推廣的時間難以預料。
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